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Muzo es rica en vegetación ya que más del 50% del municpio es zona de montaña, que afortunadamente no ha sido destruida (o al menos no extensivamente)
Por la naturaleza de su clima, la vegetación es abundante y variadísima: existen extensas zonas cubiertas de selva que poseen maderas de óptima calidad como almendro, amarillo, cedro, caoba y nogal; palmeras como cachipay. La macana abunda mucho; la ceiba, los guamos, aguacates y
mangos complementan el paisaje, sin olvidar las piñas y los naranjales
Muzo también posee una riqueza de fauna impresionante con mariposas e insectos de vistosos colores y aves hermosas de magnificos colores y figuras.